微信公众号搜"智元新知"关注
微信扫一扫可直接关注哦!

linux – 在该文件中的模式之前写入文件名

我有成千上万个类似的文件,我想在它们内部的模式之后写出各自的名字.例如:

**文件1的名称是nexus0000

文件里面有:

>Pseudomonas_1M
ATGATCCGCTTCGAGCAGGTCGGCAAACGCTATC
>Pseudomonas_2M
GTGAGCTTCGAGCAGGTCGGCGAGCCGCTATC

我想得到这个:

nexus0000>Pseudomonas_1M
ATGATCCGCTTCGAGCAGGTCGGCAAACGCTATC
nexus0000>Pseudomonas_2M
GTGAGCTTCGAGCAGGTCGGCGAGCCGCTATC

**文件2的名称是nexus0001

文件里面有:

>Pseudomonas_1M
ATGATCCGCTTCGAGCAGGTCGGCAAACGCTATC
>Pseudomonas_2M
GTGAGCTTCGAGCAGGTCGGCGAGCCGCTATC

我想得到这个:

nexus0001>Pseudomonas_1M
ATGATCCGCTTCGAGCAGGTCGGCAAACGCTATC
nexus0001>Pseudomonas_2M
GTGAGCTTCGAGCAGGTCGGCGAGCCGCTATC

等等

到目前为止,我只是设法在第一行中使用以下命令编写文件名称

for file in nexus*; do echo "$file"$"$(cat -- "$file")" > "$file"; done

谢谢您的帮助!

解决方法:

sed解决方案:

for f in nexus*; do sed -i "s/^>/$f&/" "$f"; done

或者使用gawk及其inplace扩展(自4.1.0版起可用):

for f in nexus*; do awk -i inplace '/^>/{ $0=FILENAME$0 }1' "$f"; done

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐