如何在行/列中转换 igraph 文件？

如何解决如何在行/列中转换 igraph 文件？

我想将我拥有的信息传递给带有节点的普通轴列表，但我不知道该怎么做。带有“deput”的原始数据看起来像这样。如果有人知道如何将此列表转换为更易于使用的内容，我将不胜感激。我可以使用“绘图”将图形可视化，但要对其进行编辑，我需要获得更精确的信息。

library(igraph)
dput (net2$graph_pajek)
structure(list(30,FALSE,c(1,1,2,3,4,5,6,7,13,14,15,16,18,20,21,27,29,8,9,10,11,12,19,23,24,25,26,15),list(c(1,1),structure(list(),.Names = character(0)),list(name = c("A","B","C","D","E","F","G","H","I","J","K","L","M","N","O","P","Q","R","S","T","U","V","W","X","Y","Z","AB","AC","AD","AE"
    ),deg = c(248,532,855,574,1761,261,229,216,554,628,774,223,502,295,266,910,227,312,364,260,294,741,471,392,376,292,212,287),size = c(2.,3.,3),label.cex = c(0.7,0.7,0.7
    ),id = c("A","AE"
    )),list(num = c(4,40,40),weight = c(4,18))),<environment>),class = "igraph")

解决方法

您是否正在寻找类似 get.data.frame

> get.data.frame(net)
   from to     weight
1     A  B 0.63502922
2     B  C 0.79410173
3     C  D 0.90802625
4     D  E 0.09408188
5     E  F 0.16450634
6     F  G 0.75931882
7     G  H 0.30409658
8     H  I 0.23990324
9     I  J 0.84762277
10    A  J 0.88657718

数据

由于我无法重现您帖子中的示例，因此我创建了一个虚拟示例 net，如下所示

net <- make_ring(10) %>%
  set_vertex_attr(name = "name",value = LETTERS[1:vcount(.)]) %>%
  set_edge_attr(name = "weight",value = runif(ecount(.)))

,

澄清几点：

• igraph 文件本身不是图，而是图结构（如节点和边）。
• igraph 具有绘制图形的函数，但没有单一且标准的绘制图形的方法 - 相反，可以使用不同的算法来确定视觉上理想的显示方式，而这些算法通常依赖于随机初始化。
• igraph 绘图函数的输出仅与 R 基本绘图逻辑相关，AFAIK 它们不使用在用户可理解的结构中处理坐标的中间格式。不过，您可以管理它们绘制方式的许多方面 - 请参阅 ?igraph::igraph.plotting。