如何解决在 Python 中加载 RS4 对象
我有一个包含 Seurat RS4 对象的 rds 文件。我试着跑
result = pyreadr.read_r('P1.seur.rds')
并得知该文件包含无法识别的对象。我意识到我不能像这样加载对象,并且知道还有其他关于使用 RS4 对象的教程,但是我不确定如何首先加载文件,所以我可以使用 rpy2 的函数来将其转换为 Python 数据框。如何加载对象以便我可以使用它?谢谢!
解决方法
用rpy2读取rds文件怎么样?与 pyreadr
不同,它将使用 R 自己的阅读器。
from rpy2.robjects.packages import importr
base = importr('base')
obj = base.readRDS('./foo.rds')
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