安装和使用 Cytoscape 的问题

如何解决安装和使用 Cytoscape 的问题

我在安装 Cytoscape 3_8_2 时遇到问题。我认为它开始没有正确版本的 Java。然后我安装了 Java 11。但是，我仍然没有解决这个问题。当我打开 Cytoscape 时，我无法上传任何网络表（excel 和 txt 格式）。除了无法导入文件之外，我无法在应用程序中执行任何操作。然后我下载了“系统检查器脚本”进行调试，“Windows.bat”产生了以下结果：

'jvmVariant' 不被识别为内部或外部命令， 可运行的程序或批处理文件。

Cytoscape Windows 系统要求检查器

目标 Cytoscape 版本：3.8.0

您的 Windows 版本是：

Microsoft Windows [版本 10.0.19042.1110]

Java 已安装

您的系统是 64 位

JAVA_HOME 未设置

您的 Java 主要版本是 11 您的 Java 版本至少为 11 版

您的 Java 版本要求不高于版本 11

% Total % Received % Xferd 平均速度时间时间时间电流 下载上传总花费的剩余速度 0 0 0 0 0 0 0 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 0 问题：apps.cytoscape.org 上的“应用”商店无法访问

摘要

您的系统存在一些问题。 请修复这些并再次重新运行此脚本：

• 无法访问 apps.cytoscape.org 上的应用商店

更多关于 Java 的细节

openjdk 版本“11.0.7” 2020-04-14 OpenJDK 运行时环境 采用 OpenJDK（构建 11.0.7+10） OpenJDK 64 位服务器 VM AdoptOpenJDK（构建 11.0.7+10，混合模式）

有关 apps.cytoscape.org 的更多详细信息

现在要为 apps.cytoscape.org 运行跟踪路由命令，超时为 30000 毫秒...

追踪到apps.cytoscape.org的路径[52.34.133.210] 最多超过 30 跳：

1 4 毫秒 4 毫秒 3 毫秒 10.185.180.1 2 4 毫秒 2 毫秒 3 毫秒 host-31-29.ilurtow.clients.pavlovmedia.com [216.171.31.29] 3 5 毫秒 4 毫秒 5 毫秒 host-30-2.ilurtow.clients.pavlovmedia.com [216.171.30.2] 4 7 毫秒 6 毫秒 5 毫秒 te0-3-1-19.nr51.b021117-0.ind01.atlas.cogentco.com [38.140.177.185] 5 4 ms 5 ms 4 ms be2222.rcr21.ind01.atlas.cogentco.com [154.24.66.117] 6 12 毫秒 11 毫秒 13 毫秒 be3180.ccr41.ord01.atlas.cogentco.com [154.54.45.170] 7 22 毫秒 23 毫秒 23 毫秒 be2831.ccr21.mci01.atlas.cogentco.com [154.54.42.165] 8 34 毫秒 35 毫秒 34 毫秒 be3035.ccr21.den01.atlas.cogentco.com [154.54.5.89] 9 45 毫秒 45 毫秒 46 毫秒 be3037.ccr21.slc01.atlas.cogentco.com [154.54.41.145] 10 60 毫秒 60 毫秒 60 毫秒 be3109.ccr21.sfo01.atlas.cogentco.com [154.54.44.137] 11 62 毫秒 61 毫秒 61 毫秒 be3669.ccr41.sjc03.atlas.cogentco.com [154.54.43.10] 12 64 毫秒 71 毫秒 70 毫秒 38.88.224.186 13 68 毫秒 * 67 毫秒 52.93.70.184 14 64 毫秒 71 毫秒 65 毫秒 150.222.97.89 15 77 毫秒 76 毫秒 78 毫秒 150.222.97.104 16 78 毫秒 76 毫秒 77 毫秒 52.93.133.80 17 * * * 请求超时。 18 * * * 请求超时。 19 * * * 请求超时。 20 * * * 请求超时。 21 * * * 请求超时。

我该如何解决这个问题？

解决方法

这告诉您的是您无法访问应用商店。这不应阻止您安装和运行 Cytoscape，但您需要在安装任何应用程序之前弄清楚网络问题。

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