如何解决skimage.external.TiffWriter:命名重要性
我需要将图像保存为 .tif。我无法安装新的 python 包(大学控制的计算机,使用 Anaconda),所以我决定使用 skimage.external 中的可用 Tifffile。
麻烦来了: 以下代码运行良好并保存了我的图像的 3 个通道:
from skimage.external.tifffile import TiffWriter
import numpy as np
path = '26.01.2021 NLFK CPV timeseries A3B10 imaged 07.04.2021/26.01.2021 NLFK CPV timeseries A3B10 imaged 07.04.2021/Processed'
result_img2 = np.zeros((3,512,512))
res = (6.006634765625e-08,6.006634765625e-08)
raw_b = str('abcdefg')
Meta = {}
for i,c in enumerate(result_img2):
with TiffWriter(path+'/'+'test_C'+str(i)+'.tif') as tif:
tif.save(np.array(c,dtype='uint8'),resolution=res,description=raw_b,Metadata=Meta)
但我不能将我的图像命名为“测试”! 但是,这样做:
filename = "07.04.2021 NLFK nucleolin r488 A3B10 m546 DAPI mock Preview 2_nucleus1_"
with TiffWriter(path+'/'+filename+str(i)+'.tif') as tif:
tif.save(np.array(c,Metadata=Meta)
导致 Errno 2
错误。
keepcharacters = (' ','.','_')
filename = "".join(c for c in filename if c.isalnum() or c in keepcharacters).rstrip()
或编码 filename.encode('utf8')
并且它也失败了(再次,Errno 2
)。
名称表示每次实验的情况,每次都会改变,所以我需要这样保存。 快速检查后,我可以将其保存在 .py 的根目录下。但同样,我需要将文件保存在各自的文件夹中。 知道我的麻烦在哪里吗?
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。