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用于特定值的 coxph 块代码以在 Markdown 中作为文本发布

如何解决用于特定值的 coxph 块代码以在 Markdown 中作为文本发布

什么是 coxph 公式的块代码,因为我想提取系数 (exp(coef) and p value) 作为标记文本的文本,以便将来编织到 HTML?

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解决方法

获得系数和 p 值的一种简单方法是使用 tidy 包中的 broom 函数。由于您没有提供示例,我使用了 coxph Rdocumentation 页面中显示的示例。

library(broom)
library(survival)

# Taken from the coxph function documentation example
test1 <- list(time=c(4,3,1,2,3),status=c(1,0),x=c(0,sex=c(0,1)) 

# Fit a stratified model 
resul <- coxph(Surv(time,status) ~ x + strata(sex),test1) 

# Use tidy to convert result into a tibble
resul_df <- tidy(resul)

# Call the desired element by column name
# Exponent of coefficient
exp(resul_df$estimate)
# P value
resul_df$p.value

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