如何从另一个列表中创建特定序列的新列表？

如何解决如何从另一个列表中创建特定序列的新列表？

我想知道如何按照公共序列制作一个拉取的特定序列值（前三个）的列表，以放置到另一个列表中。如果有意义的话，这与实际应用程序相比更基于概念。这是我试图完成的一个例子，

seq = 'ATTACGA'
og_list = ['ATGGGCATAGA','GCCTGAACTT','GAATTACGAAGAGT','AAGTCCAAT','GCACATTACGATAG']

理想情况下，它会从存储在 seq 变量中的公共序列中提取剩余序列以获得：

['AGA','TAG']

这是因为这些值是 seq 公共序列值之后的三个。我想可以使用 find (.find()) 函数，但由于我是 Python 新手，如果有人能帮我解决这个问题，那就太好了。

这是我目前所拥有的：

seq = 'ATTACGA'
og_list = ['ATGGGCATAGA','GCACATTACGATAG']
new_list = []
if seq in og_list:
    og_list.find(seq)
    new_list.append(seq)
print(seq)

这显然不是削减它。我不确定如何从常见的 seq 中获取接下来的三个值 - 也许切片可能有效？

解决方法

如果字符串在字符串中，可以按序列分割字符串，然后对结果的第二部分进行切片

seq = 'ATTACGA'
og_list = ['ATGGGCATAGA','GCCTGAACTT','GAATTACGAAGAGT','AAGTCCAAT','GCACATTACGATAG']
new_list = [x.split(seq)[1][:3] for x in og_list if seq in x]
print(new_list) # ['AGA','TAG']

,

我不知道输入列表有多长，所以生成器似乎是正确的方法：

def follow_up(seq,samples,n):
    l = len(seq)
    for s in samples:
        if (p := s.find(seq)) >= 0:
            yield s[p+l:p+l+n]


seq = 'ATTACGA'
og_list = ['ATGGGCATAGA','GCACATTACGATAG']

# just collecting in a list here to print the result
print(list(follow_up(seq,og_list,3)))

结果：

['AGA','TAG']

,

以下几乎是将您想要的内容描述成代码（使用切片）的字面翻译：

target = 'ATTACGA'
og_list = ['ATGGGCATAGA','GCACATTACGATAG']

new_list = []
for seq in og_list:
    pos = seq.find(target)
    if pos > -1:
        new_list.append(seq[pos+len(target): pos+len(target)+3])

print(new_list)  # -> ['AGA','TAG']