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与 glmmTMB 的空间自相关

如何解决与 glmmTMB 的空间自相关

我有一个大型(约 75,000 例)沿横断面动物计数的数据集。对于每个采样日(每年多天、多年,总共 181 天),对所有样条进行采样(数据中共有 1,177 个唯一坐标)。我使用的是 glmmTMB 模型,具有 Year 随机效应和一组固定效应。 Moran's I 对于没有空间自相关的模型的 75% 的残差是显着的。

当我在 glmmTMB covariance structure tutorial 之后添加空间自相关时,我收到错误 Memory allocation fail in function 'MakeADGradobject'。我认为这是由于大量独特的坐标?我有哪些选择?缩放坐标无济于事...

模型和自相关规范:

data$pos <- numFactor(data$x,data$y) # x and y are UTM coordinates
mod <- glmmTMB(Count ~ ...fixed effects.... + (1|year) + exp(pos + 0 | Date.YYYYMMDD) + offset(log(Effort)),family = nbinom2,data = data) 

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