如何解决如何使用 DDP 训练模型运行 nnU-Net 推理?
我正在尝试让 nnU-Net - 一种深度学习分割方法 (https://github.com/MIC-DKFZ/nnUNet) - 在使用 nnUNetTrainerV2_DDP
在训练数据集上完成我的模型训练后运行推理。
我在存储模型的文件夹上运行 nnUNet_change_trainer_class
,我看到 checkpoint.model
和 modal_best
pkl 文件在文件夹中更新,但是在我的测试集上开始预测后,我得到以下错误:
AssertionError: model output folder not found. Expected: E:\Pieterjan\nnUNet_project\nnUNet_trained_models\nnUNet\3d_fullres\Task101_Lung\nnUNetTrainerV2__nnUNetPlansv2.1
nnUNetTrainerV2__nnUNetPlansv2.1
似乎是使用仅在一个 GPU 上训练的模型开始推理时使用的默认值,但我使用了两个 GPU(因此我使用了 nnU-Net 提供的 _DDP trainer
)。我也尝试简单地重命名文件夹,但问题仍然存在。
如何设置 nnU-Net 以使用 nnUNetTrainerV2_DDP__nnUNetPlansv2.1
对我的测试数据集进行推理?
提前干杯!
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