有没有办法用相关系数作为连接的基础来绘制网络图？

如何解决有没有办法用相关系数作为连接的基础来绘制网络图？

我希望根据列之间的相关性绘制网络图，例如。 我的数据有 200 行和 100 列，示例如下：

A (Zone1)	B(Zone1)	C (Zone2)	D (Zone2)	E (Zone3)	F (Zone3)	G（决赛）
2	23	21	4	4	34	33
4	-2	7	3	10	4	12
23	21	4	4	34	33	12
10	4	12	0	4	-2	7

所以我想看到的网络是根据它们的相关值按区域划分的列名：

因此，如果 2 列之间没有良好的相关性 (

解决方法

您可以使用以下工具：

• pandas.read_csv 从 csv 文件中读取数据；
• .corr to get the pairwise correlations;
• networkx to build the graph。

import pandas
import itertools
import networkx
import matplotlib.pyplot as plt

data = pandas.read_csv('data.csv')

vertices = data.columns.values.tolist()
edges = [((u,v),data[u].corr(data[v])) for u,v in itertools.combinations(vertices,2)]
edges = [(u,v,{'weight': c}) for (u,c in edges if c >= 0.3]

G = networkx.Graph()
G.add_edges_from(edges)

networkx.draw(G,with_labels=True,font_weight='bold')
plt.show()

另见这个问题：

• Add edge weights to plot output in networkx