如何解决气隙环境 - 安装 R 包源与二进制文件
我们办公室有一个 ubuntu linux 服务器，这是一个气密环境。无法访问外部网络。
但是我想安装几个 R 包，例如 ggplot2,Database Connector,dplyr,Tidyverse 等。我有超过 10-15 个包要下载
虽然我无法编写常用命令 install.packages("DatabaseConnector")，但我必须从 CRAN 下载压缩文件夹，如图 here。
我是 R 的新手。那么，你能帮我解决下面给出的问题吗？
a) 为什么 linux 系统没有文件？我只看到 windows binaries 和 macOS binaries。我应该下载哪一个？
b) 我应该下载 binaries 还是 package source？哪个容易安装？
c) 当我从 CRAN 下载如上所示的 zipped file 包时，如 here 所示，依赖项也会自动下载吗？还是我应该查看错误信息并继续一一下载？
d) 由于我在气密环境中工作，因此有效执行此过程的最佳方法是什么。
解决方法
在 linux 下，软件包总是从源代码安装。没有用于 linux 的官方二进制包。但是，您的发行版可能会在官方存储库中提供其中一些。 Ubuntu 可以。然而，这些往往是相当旧的版本，通常仅限于少数最重要的软件包。因此，对于 linux，您必须下载源包。 zip 文件适用于 Windows，无法使用。
您还需要下载软件包的所有依赖项。对于像 tidyverse 这样的东西，这将是一个巨大的数字。手动跟踪这些是很多工作。最简单的方法可能是在气隙系统之外使用 miniCRAN 之类的软件包来构建 CRAN 的选择性副本。您可以指定所需的包，该包将下载所有依赖项。然后，您可以将下载的目录复制到您的服务器，将 install.packages 指向正确的方向并像往常一样使用 install.packages 进行安装。详情请参阅https://andrie.github.io/miniCRAN/articles/miniCRAN-introduction.html。
您可能还会遇到这样的问题，即您的系统没有构建所有软件包所需的所有依赖项。例如，在 ubuntu 下，您需要安装 libxml2-dev 才能安装 xml 软件包。为此，您需要使用 ubuntu 的包管理器。如何在气隙系统上做到这一点是另一个问题
版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容， 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报，一经查实，本站将立刻删除。
