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在 adonis2

如何解决在 adonis2

我是一名本科生,刚接触 R 和素食主义者。非常感谢任何帮助!!

我的研究涉及每个横断面不同距离的 3 个样方的社区数据,每个站点 4 个横断面。我想看看嵌套在横断面内的样方之间是否存在显着差异。我的排列是在横断面内排列样方,保持横断面和站点完好无损。这是我如何尝试的代码

adonis2(samp ~group_transect/group_dist,data=df,permutations=perm,by="margin")

这是测试嵌套在横断面 (group_transect) 中的距离类 (group_dist) 的影响的正确语法还是应该交换这些变量的顺序?

#Marginal effects of terms
#Blocks:  group_site 
#Plots: group_transect,plot permutation: none
#Permutation: series
#Number of permutations: 999

#adonis2(formula = samp ~ group_transect/group_dist,data = df,#permutations = ctrl,by = "margin")
#                           Df SumOfSqs      R2      F Pr(>F)   
#group_transect:group_dist   8    3.290 0.04915 1.5068  0.002 **
#Residual                  232   63.312 0.94598                 
#Total                     243   66.927 1.00000                 
#---
#Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

这是我得到的输出。假设我的嵌套正确,那么我是否正确地将其解释为横断面内距离类的显着影响?我如何判断横断面之间是否存在显着差异(使用 site/transect/distanceclass 运行模型不会给我一个网站内横断面的效果)?

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