如何解决Bam 文件的排序运行很慢
我正在尝试使用 samtools 排序功能对一个不大的 bam 文件(命名为 PT2)(大小为 180 兆字节)进行排序。排序永远不会结束,也没有出现错误消息。我已经使用(家庭帐户的 proc 文件夹中的 meminfo 文件)检查了 VM Ubunto 的内存。我还有大约 80 个演出光盘空间
第一个代码:samtools sort -ooutputs/PT2_sorted.bamoutputs/PT2.bam(很慢wwww)
第二个代码:samtools sort -ooutputs/PT2_sorted.bamoutputs/PT2.bam(很慢)
您认为工作缓慢的原因是什么?有什么建议吗?
谢谢
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