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通过python去噪或平滑钙成像

如何解决通过python去噪或平滑钙成像

我正在尝试平滑我的时间序列荧光强度数据。 我参考了Jia et al.,2011,Nature protocol (doi:10.1038/nprot.2010.169)的Box 1中的计算方法,但有一些问题需要我遵循。

  1. 他们通过使用指数加权移动平均来应用噪声过滤,其中权重与python的pandas.ewm方法中的权重不同。有没有办法改变ewm方法中的权重?

  2. 作者建议的参数假设以每秒 30 帧(= 30 Hz)的速度获取数据,提取如下。”1. 通常,30 Hz 成像的有效滤波是通过以下参数实现的:τ0 = 0.2 秒,τ1 = 0.75 秒,τ2 = 3 秒。” 当我有不同的频率时,我找不到如何应用它,你知道这些参数是否有方程或关系吗?

真诚的,朴

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