微信公众号搜"智元新知"关注
微信扫一扫可直接关注哦!

如何使用 Pandas 操作包含列表的列以删除非常相似的元素?

如何解决如何使用 Pandas 操作包含列表的列以删除非常相似的元素?

我有一个 Pandas DataFrame,它有 2 列:条​​形码和轨迹,如下所示:

enter image description here

locus 列包含列表 - 有些列表只有一个元素,而其他列表可以有多个元素。从圆圈值可以看出,有一些元素共享 chr 编号和最后一个编号,但与同一单元格中的其他元素相比,中间的数字略有不同。如果中间的数字之间的差异小于5,我想删除较低的对,只保留一对。

到目前为止,我已将轨迹列拆分为由“-”分隔的单独列。所以,我有 5 列,如下所示:

enter image description here

我不确定这是否是解决此问题的最佳方法,但有人知道如何过滤掉这些列表中与同一单元格中的其他元素如此密切相关的元素吗?

编辑:

这是示例代码(DataFrame 的字典):

ex = {'CTCTTTCTCACCCCCCTCTT': '[chr6-249253-16,chr9-188167-0,chr4-1417473-0]','CACCTATCACTACTACTTGT': '[chr11-438013-0,chr11-438014-0,chr11-438012-0]','CCCGCTATCTATTGGCTTCT': '[chr2-335519-16]','GATCCTCCCCGTTTCTTCAT': '[chr4-504274-0,chr4-504276-0]','CTATCCCTTCTCATCCTGTT': '[chr16-518323-16,chr9-285852-16]'}

example = pd.DataFrame(ex.items())

example = example.rename(columns={0: "barcode",1: "locus"})

print(example)

这是结果的图片,并在元素周围圈起来,其中中间值几乎与同一单元格中同一列表中其他元素的中间值相同。我想删除几乎相同的元素,只保留其中一个

enter image description here

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


Selenium Web驱动程序和Java。元素在(x,y)点处不可单击。其他元素将获得点击?
Python-如何使用点“。” 访问字典成员?
Java 字符串是不可变的。到底是什么意思?
Java中的“ final”关键字如何工作?(我仍然可以修改对象。)
“loop:”在Java代码中。这是什么,为什么要编译?
java.lang.ClassNotFoundException:sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver发生异常。为什么?
这是用Java进行XML解析的最佳库。
Java的PriorityQueue的内置迭代器不会以任何特定顺序遍历数据结构。为什么?
如何在Java中聆听按键时移动图像。
Java“Program to an interface”。这是什么意思?