在扩展中强制执行通配符约束

如何解决在扩展中强制执行通配符约束

我想收集与正则表达式 ^fs_node\d+\.xyz$ 匹配的所有文件，但我不知道如何编写扩展以便 glob 使用约束。现在，

wildcard_constraints:
    nodeidx = "\d+",rule all:
    input:
        expand("fs_node{i}.xyz",i=glob_wildcards("fs_node{nodeidx}.xyz").nodeidx)

生成的输出也匹配带有 irc 的文件，这是我不想要的：

    input: fs_node37_irc.xyz,fs_node41_irc.xyz,fs_node32.xyz,fs_node10.xyz,fs_node43.xyz,fs_node2.xyz,fs_node30_irc.xyz,fs_node16.xyz,fs_node45.xyz,fs_node23_irc.xyz,fs_node2_irc.xyz,fs_node44_irc.xyz,fs_node33_irc.xyz,fs_node35.xyz,fs_node1.xyz,fs_node28_irc.xyz,fs_node42.xyz,fs_node15_irc.xyz,fs_node12_irc.xyz,fs_node35_irc.xyz,fs_node42_irc.xyz,fs_node44.xyz,fs_node31.xyz,fs_node17_irc.xyz,fs_node8_irc.xyz,fs_node43_irc.xyz,fs_node15.xyz,fs_node5_irc.xyz,...

如何在扩展中正确实施（全局）通配符约束？它是全球性的，因为它也被用于其他地方。

解决方法

也许 glob_wildcards 不够灵活。我会明确列出所有文件，选择那些你想用一些正则表达式保留的文件，提取变量部分 nodeidx 并将其用作通配符。未测试：

import os
import re

listdir = os.listdir(os.getcwd())

nodeidx = []
for x in listdir:
    if re.match('^fs_node\d+\.xyz$',x):
        idx = re.sub('^fs_node','',re.sub('\.xyz$',x))
        _ = int(idx) # sanity check
        nodeidx.append(idx)

wildcard_constraints:
    nodeidx = '|'.join([re.escape(x) for x in nodeidx])

rule all:
    input:
        expand("fs_node{nodeidx}.xyz",nodeidx= nodeidx)