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Cytoscape中相对距离的细胞邻域分析

如何解决Cytoscape中相对距离的细胞邻域分析

是否可以通过 cytoscape 中定义的分数显示具有相对距离的邻域分析?例如:2=不在直接邻域内,1=在直接邻域内,0=随机排列。

采用更大的值非常好,我也会在我的分析中实现这一点。不幸的是,我仍然不清楚应该使用哪种方法来可视化相对距离。根据我所阅读的内容,“力导向”范式应该是我分析的最佳解决方案。有人同意吗? 提前致谢,并向约书亚致以最诚挚的问候

解决方法

当然,你当然可以做类似的事情。真正的问题是您希望网络是什么样的?如果您试图通过使用相对距离来查看某种聚类效果,我会使用不同的数字 - 可能 100=不在直接邻域中,1=在直接邻域中,并且为随机排列留空。如果您想将相对距离用于其他用途(例如边缘类型或颜色),则缩放比例无关紧要。 -- 滑板车

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