微信公众号搜"智元新知"关注
微信扫一扫可直接关注哦!

在 MATLAB 中加速读取 netcdf 数据

如何解决在 MATLAB 中加速读取 netcdf 数据

我有一个使用 ncread() 读取多个 netcdf 文件的 matlab 脚本,它执行了大约 7220 次。它多次读取以避免内存过载。一个例子如下:

for l = 1:380

% some code here

   for r = 1:19
    
       % code here
    
       % Import
       T = ncread(sprintf(fn1,str,hx,A),'THETA',[1 1 1 valID],...
           [Inf Inf nlvs 19],[1 1 1 1]);
       eta = ncread(sprintf(fn2,'ETAN',...
           [Inf Inf 1 19],[1 1 1 1]);
       w = ncread(sprintf(fn3,'WVEL',[1 1 1 1]);

       % more code here

   end
   
   % more code here
end

当我使用相当粗糙的网格分辨率 200x200x53 (nx x ny x nz) 运行分析时,在单个节点上大约需要 11 小时。这可以。但我正在尝试分析分辨率更高的模型,所以 1000x1000x75。这意味着运行时间大约长 25 倍,因此需要大约 11 天。有没有办法可以多线程/并行读取 netcdf 数据,以便我可以使用更多节点运行脚本。或者有没有办法使用不同的 matlab 函数来加快读取速度。

我曾尝试在网上搜索有关如何加快速度的一些提示,但找不到解决方案。任何帮助真的很感激。

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。