如何解决在 MATLAB 中加速读取 netcdf 数据
我有一个使用 ncread() 读取多个 netcdf 文件的 matlab 脚本,它执行了大约 7220 次。它多次读取以避免内存过载。一个例子如下:
for l = 1:380
% some code here
for r = 1:19
% code here
% Import
T = ncread(sprintf(fn1,str,hx,A),'THETA',[1 1 1 valID],...
[Inf Inf nlvs 19],[1 1 1 1]);
eta = ncread(sprintf(fn2,'ETAN',...
[Inf Inf 1 19],[1 1 1 1]);
w = ncread(sprintf(fn3,'WVEL',[1 1 1 1]);
% more code here
end
% more code here
end
当我使用相当粗糙的网格分辨率 200x200x53 (nx x ny x nz) 运行分析时,在单个节点上大约需要 11 小时。这可以。但我正在尝试分析分辨率更高的模型,所以 1000x1000x75。这意味着运行时间大约长 25 倍,因此需要大约 11 天。有没有办法可以多线程/并行读取 netcdf 数据,以便我可以使用更多节点运行脚本。或者有没有办法使用不同的 matlab 函数来加快读取速度。
我曾尝试在网上搜索有关如何加快速度的一些提示,但找不到解决方案。任何帮助真的很感激。
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