使用光栅显示 tiff 图像的特定部分,而无需加载整个文件

如何解决使用光栅显示 tiff 图像的特定部分,而无需加载整个文件

我有一个包含地图的大型 tiff 文件(大约 2GB)。我已经能够成功读取数据,甚至使用以下 python 代码显示它:

import rasterio
from rasterio.plot import show

with rasterio.open("image.tif") as img:
    show(img)
    data = img.read()

这很好用。但是,我需要能够显示此地图的特定部分,而不必将整个文件加载到内存中(因为它占用了太多 RAM,并且在许多其他 PC 上不可行)。为此,我尝试使用 Window 类 rasterio,但是当我尝试显示地图时,结果与显示完整地图的方式不同(好像它导致数据丢失):

import rasterio
from rasterio.plot import show
from rasterio.windows import Window

with rasterio.open("image.tif") as img:
    data = img.read(window=Window(0,100000,100000))
    show(data)

所以我的问题是,如何在不必将整个文件加载到内存中的情况下显示地图的一部分,同时还使它看起来好像是从完整的地图图像中裁剪出来的?

提前致谢:)

解决方法

它在第一种情况下显示得很好,但在第二种情况下显示良好的原因是,在第一种情况下,您将 rasterio.DatasetReader 的实例传递给 show (show(img)),但在第二种情况下,您传入一个 numpy 数组 (show(data))。 DatasetReader 包含附加信息,特别是 show 使用的仿射变换和颜色解释。

show 在第一种情况下(对于 RGB 数据)所做的其他事情可以为窗口情况重新创建,如下所示:

import rasterio
from rasterio.enums import ColorInterp
from rasterio.plot import show
from rasterio.windows import Window

with rasterio.open("image.tif") as img:
    window = Window(0,100000,100000)

    # Lookup table for the color space in the source file
    source_colorinterp = dict(zip(img.colorinterp,img.indexes))

    # Read the image in the proper order so the numpy array will have the colors in the
    # order expected by matplotlib (RGB)
    rgb_indexes = [
        source_colorinterp[ci]
        for ci in (ColorInterp.red,ColorInterp.green,ColorInterp.blue)
    ]
    data = img.read(rgb_indexes,window=window)

    # Also pass in the affine transform corresponding to the window in order to
    # display the correct coordinates and possibly orientation
    show(data,transform=img.window_transform(window))

(我通过查看源代码 here 弄清楚了 show 的作用)


对于具有单通道的数据,用于绘图的底层 matplotlib 库根据数据的最小值和最大值缩放颜色范围。要获得与以前完全相同的颜色,您需要知道整个图像的最小值和最大值,或者一些相当接近的值。

然后你可以明确告诉 matplotlib 的 imshow 如何缩放:

with rasterio.open("image.tif") as img:
    window = Window(0,100000)
    data = img.read(window=window,masked=True)

    # adjust these
    value_min = 0
    value_max = 255

    show(data,transform=img.window_transform(window),vmin=value_min,vmax=value_max)

额外的 kwargs(如此处的 vminvmax)将传递给 matplotlib.axes.Axes.imshow,如 here 所记录。 来自 matplotlib documenation

vmin、vmax:浮动,可选
当使用标量数据且没有明确的范数时, vmin 和 vmax 定义颜色图覆盖的数据范围。默认情况下,颜色图涵盖所提供数据的完整值范围。当给出范数时,不推荐使用 vmin/vmax。使用 RGB(A) 数据时,忽略参数 vmin/vmax。

那样你也可以改变它使用的颜色图等

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei'] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -> systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping("/hires") public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate<String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work>npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-
参考1 参考2 解决方案 # 点击安装源 协议选择 http:// 路径填写 mirrors.aliyun.com/centos/8.3.2011/BaseOS/x86_64/os URL类型 软件库URL 其他路径 # 版本 7 mirrors.aliyun.com/centos/7/os/x86
报错1 [root@slave1 data_mocker]# kafka-console-consumer.sh --bootstrap-server slave1:9092 --topic topic_db [2023-12-19 18:31:12,770] WARN [Consumer clie
错误1 # 重写数据 hive (edu)> insert overwrite table dwd_trade_cart_add_inc > select data.id, > data.user_id, > data.course_id, > date_format(
错误1 hive (edu)> insert into huanhuan values(1,'haoge'); Query ID = root_20240110071417_fe1517ad-3607-41f4-bdcf-d00b98ac443e Total jobs = 1
报错1:执行到如下就不执行了,没有显示Successfully registered new MBean. [root@slave1 bin]# /usr/local/software/flume-1.9.0/bin/flume-ng agent -n a1 -c /usr/local/softwa
虚拟及没有启动任何服务器查看jps会显示jps,如果没有显示任何东西 [root@slave2 ~]# jps 9647 Jps 解决方案 # 进入/tmp查看 [root@slave1 dfs]# cd /tmp [root@slave1 tmp]# ll 总用量 48 drwxr-xr-x. 2
报错1 hive> show databases; OK Failed with exception java.io.IOException:java.lang.RuntimeException: Error in configuring object Time taken: 0.474 se
报错1 [root@localhost ~]# vim -bash: vim: 未找到命令 安装vim yum -y install vim* # 查看是否安装成功 [root@hadoop01 hadoop]# rpm -qa |grep vim vim-X11-7.4.629-8.el7_9.x
修改hadoop配置 vi /usr/local/software/hadoop-2.9.2/etc/hadoop/yarn-site.xml # 添加如下 <configuration> <property> <name>yarn.nodemanager.res