SimpleHypergraphs.jl - 从文本文件加载超图

如何解决SimpleHypergraphs.jl - 从文本文件加载超图

我正在使用 SimpleHypergraphs.jl 库并尝试从文本文件（例如 csv）构建超图。

例如，我想从这样的 csv 文件加载超图：

0.0,7.0,0.0,0.0
1.3,2.8,4.5,0.0
0.0,1.3,3.1,4.2
1.2,5.6,5.0

using SimpleHypergraphs
using CSV

df = CSV.read("edge_weights.csv",DataFrame)
m = Matrix{Float64}(df)
h = Hypergraph(m)

我收到以下错误： “错误：方法错误：没有方法匹配 Hypergraph(::Matrix{Float64})”

我是 Julia 的新手，我非常感谢我如何实现这一目标的示例。谢谢！

解决方法

作为 Hypergraph 构造函数传递的矩阵应该具有 Union{Nothing,T} 类型的元素，其中 T 是某种数字类型（例如 Matrix{Union{Float64,Nothing}} 而不仅仅是 {{ 1}}。

在 SimpleHypegraphs.jl 中，我们使用 Matrix{Float64}（而不是 nothing）来表示顶点不属于超边，因为在许多超图算法/应用程序中，顶点可能属于到零权重的超边。

因此，您可以使用以下代码读取您的文件（为了重现性，我将文件内容放入文本变量中）：

0

这个矩阵现在可以很容易地用作 using DataFrames,CSV,SimpleHypergraphs txt = """0.0,7.0,0.0,0.0 1.3,2.8,4.5,0.0 0.0,1.3,3.1,4.2 1.2,5.6,5.0""" df = CSV.read(IOBuffer(txt),DataFrame;header=0) mat = Matrix{Union{Float64,Nothing}}(df) 构造函数。

Hypergraph

但是，这可能不是您所需要的，因为零 (julia> h1 = Hypergraph(mat) 4×4 Hypergraph{Float64,Nothing,Dict{Int64,Float64}}: 0.0 7.0 0.0 0.0 1.3 2.8 4.5 0.0 0.0 1.3 3.1 4.2 1.2 0.0 5.6 5.0 ) 表示顶点属于零权重的超边的情况：

0.0

因此，您实际上可能希望将零转换为 draw(h1,HyperNetX) 以表示顶点不属于超边的情况：

nothing

现在你得到了你想要的：

h2 = Hypergraph(replace(mat,0 => nothing))