Snakemake 使用错误的环境

如何解决Snakemake 使用错误的环境

我正在从 shell 脚本调用 Snakemake 工作流程。
但首先我需要激活一个包含snakemake 和其他已安装库的环境。

source ${CONDA_HOME}/etc/profile.d/conda.sh
conda activate myenv
# then call the workflow.

snakemake 工作流程中的规则使用 conda: 创建自己的环境。 规则之一使用python运行一些脚本：

rule readsstat:
    """
    Input is the reads output is info about reads
    """
    input: expand(data_dir + "/{sample}",sample=sample_list)
    output:data_dir + "/statitics/raw_reads/reads_stat.txt",message: "Calculating read coverage statitics for: {input}",params:
        read_stat_script = rawcoverage_script,threads: config['read_raw_coverage_threads']
    benchmark: data_dir + "/benchmark/raw_reads/stat.benchmark.txt"
    conda: STAT_ENV
    shell:
        """
        python {params.read_stat_script} -i {input} -o {output} -t {threads}
        """

问题是在规则激活适当的环境而不是使用它之后（例如，.snakemake/conda/532a617ec7374b7bff46f066e73/bin/python），他们仍然使用我之前在调用脚本中激活的 myenv python envs/myenv/bin/python。

知道如何解决这个问题吗？

谢谢

更新：
版本
conda 4.10.1
Snakemake 6.2.1

解决方法

问题在于：
source ${CONDA_HOME}/etc/profile.d/conda.sh
删除此行使 Snakemake 按预期工作。
谢谢