如何解决神经影像“nipype”插件不起作用
我正在做一些事情,这实际上是我第一次,所以事情对我来说还不是很清楚,我运行了这段代码:
pip install nipype
from nipype import Node,Workflow
from nipype.interfaces.fsl import SliceTimer,MCFLIRT,Smooth
slicetimer = Node(SliceTimer(index_dir=False,interleaved=True,time_repetition=2.5),name="slicetimer")
mcflirt = Node(MCFLIRT(mean_vol=True,save_plots=True),name="mcflirt")
smooth = Node(Smooth(fwhm=4),name="smooth")
preproc01 = Workflow(name='preproc01',base_dir="dir_path")
preproc01.connect([(slicetimer,mcflirt,[('slice_time_corrected_file','in_file')]),(mcflirt,smooth,[('out_file','in_file')])])
slicetimer.inputs.in_file = "file_path"
preproc01.run('MultiProc')
"Could not import plugin module: nipype.pipeline.plugins"
preproc01.write_graph(graph2use='orig')
'No command "dot" found on host. Please check that the corresponding package is installed.'
如果有人知道解决方案,请帮助我。 顺便说一句,我是从视频系列中做到这一点的,这是链接:https://www.youtube.com/watch?v=4FVGn8vodkc&t=4414s nipype 展示部分。
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