如何解决R:找不到命令
我想安装 rJava
,但由于以下建议而失败:
Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
If in doubt,re-run "R CMD javareconf" as root.
ERROR: configuration Failed for package ‘rJava’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/rJava’
* restoring prevIoUs
‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/rJava’
因此,我遵循此建议(以及其他人似乎建议的建议)并在终端中运行 R CMD javereconf
,但现在我收到消息 zsh: command not found: R
。
我怎样才能让 R CMD javereconf
工作?
谢谢。
编辑:虽然我遵循了@Till 建议的博文,但我仍然很难运行 R CMD javereconf
(同样的错误)。与此同时,我想我应该提到我正在使用带有 Apple M1 芯片的 MacOS Big Sur。
键入 R.home()
时,RStudio 返回 /Library/Frameworks/R.framework/Resources/R
。
解决方法
目前 CRAN 的 R 安装包中存在一个错误,导致它无法正确安装指向 R
和 Rscript
的符号链接以供命令行使用。我刚刚通过检查其 4.0.5 安装包中的 postflight 脚本验证了这一点。
基本上,存在一个问题,即 uname
检查不知道 20 及以上版本的操作系统。
如果您的 uname -r
发行版本超过 20,这将解释安装失败的原因。我的建议是通过执行以下操作手动创建包应该创建的符号链接:
if uname -r | grep '^2' >/dev/null; then
## 15.0 and higher don't allow messing with /usr/bin
## so use /usr/local/bin instead
if [ ! -e /usr/local/bin ]; then
mkdir -p /usr/local/bin
fi
cd /usr/local/bin
# create convenience links to R and Rscript
rm -f R Rscript
ln -s /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R .
ln -s /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/Rscript .
fi
我很快就会向 R-project 提交错误。
,通过在 Rstudio 的 R 控制台上运行 R.home()
来查找 R 和 Rscript 在磁盘上的位置。
然后,按照 this 指南并从 R.home()
复制返回的位置并粘贴到 /etc/paths
上的新行。
然后,重新启动终端并运行 R CMD javareconf
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