如何解决在 scipy.cluster.hierarchy 中分离部分树状图
我有一个包含 900 个叶子(项目)的树状图。我已经绘制了完整的树状图,这让我对这些项目的聚类有了一个大致的了解。不过由于树叶较多,无法看清细节。因此,我想在某个距离级别拆分树状图,并为每个“子树状图”创建单独的图,以便叶子和叶子标签变得可读。
我已经寻找了一种方法来做到这一点,但只找到了完整树状图的自定义。
我的想法是使用 fcluster
来查找哪些叶子对应于哪个簇,然后仅与那些叶子重复链接。但是,对于从用户角度来看应该非常简单的功能,这感觉有点过分了。你知道有什么方法可以用一行或几行来做到这一点吗?
我正在使用 linkage
中的 dendrogram
和 scipy.cluster.hierarchy
并输入已用 squareform
中的 scipy.spatial.distance
转换的距离矩阵(而不是数据点)
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