如何解决有没有办法在 RPhyr 和 MuMin 包中疏通 PGLMM_compare 模型？
我正在进行比较分析，我的响应变量是 0 或 1，因此我需要使用二项式误差分布进行系统发育校正分析。我使用 phyr 包 (https://rdrr.io/github/daijiang/phyr/man/pglmm_compare.html) 中的 PGLMM_compare 函数创建了一个包含所有变量的完整模型，但 MuMin 不支持将此输出作为“全局模型”，因此我无法对其进行疏浚。我正在寻找一种方法来找到最佳模型并可能从这些模型中执行模型平均，但是这些包似乎不兼容。手动创建所有模型会很困难，因为我有大约 8 个解释变量。有没有办法疏通具有二项式错误结构的系统发育模型？提前致谢。
解决方法
您至少需要为 dredge 和 model.avg 实现以下方法才能与 pglmm_compare 一起使用：
nobs.pglmm_compare(object,...)
logLik.pglmm_compare(object,...)
coef.pglmm_compare(object,...)
coefTable.pglmm_compare(model,...)
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