如何解决使用 testthat 时在 foreach 中加载包时出错
我正在尝试使用带有 testthat 的单元测试来调试问题。如果手动运行,代码运行良好,但是似乎在运行 test()
时,foreach 中的工作人员似乎无法访问我正在测试的包内的包或函数。代码相当复杂,所以我没有一个很好的工作示例,但这里是结构的大纲:
tests/testthat 中的单元测试:
test_that("dataset runs successful",{
expect_snapshot_output(myFunc(dataset,params))
})
MyFunc 调用另一个 func,并在该 func 中创建工作线程来运行一些代码:
final_out <- foreach(i = 1:nrow(data),.combine = c,.export = c("func1","func2","params"),.packages = c("fields","dplyr")) %dopar% {
output = func1(stuff)
more = func2(stuff)
out = rbind(output,more)
return (out)
}
工作人员似乎无法访问 func1
、func2
等。
有什么想法吗? 正如我提到的,这只是尝试运行单元测试时的一个问题,我怀疑它与我正在测试的包的加载方式有某种关系?
解决方法
当工作人员启动时,他们没有正常会话拥有的全套软件包;当测试在本地会话中运行时,将搜索路径中包的所有包名称传递给 .packages
参数。
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