如何解决predict.coxph 在类型为“风险”时有效,但在类型为“预期”或“生存”时无效
我有一个多类 coxph 模型,我试图用它来预测结果(R - survival
包,v 3.1-12)
最初,我想将模型应用回整个训练集,以向业务用户展示它正在做什么(在应用于新案例之前)。
例如
df <- data.frame (ID = c(1,1,2,3,3),start = c(0,5,9,7,10,12),end = c(4,8,12,6,14,11,14),fact = c('a','a','b','b'),status = c(0,2)
)
df$fact <- as.factor(df$fact)
df$status <- as.factor(df$status)
library(survival)
eg.coxph <- coxph(Surv(start,end,status) ~
fact,data = df,id = ID)
predict(eg.coxph,type = c('risk')) # works
predict(eg.coxph,type = c('survival')) # does not work
predict(eg.coxph,type = c('survival'),collapse = ID) # does not work
我不清楚为什么会收到此错误:
Error in predict.coxph(eg.coxph,type = c("survival")) :
Data is not the same size as it was in the original fit
当我尝试返回 type = 'expected' 或 type = 'survival' 值而不是 lp 或 risk 时?
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