如何解决有没有办法使用 Ibis (impala) 迭代表行
我有一个相当大的 ibis TableExpr,我想遍历行以生成专门的文件输出(FASTA 核苷酸序列)。有什么办法可以用 ibis 做到这一点,还是我应该调用 execute 来创建一个可以调用 iterrows 的 Pandas DataFrame?
解决方法
你应该像你说的那样迭代 Pandas DataFrame。
或者你也应该能够获得后端生成的 Impyla 游标,调用比 fileContent
更低级别的函数。但是当我们发布 Ibis 2.0 时,这些功能可能会发生变化,因此您的代码很可能会损坏。
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