python-igraph 联合与当前图形问题

如何解决python-igraph 联合与当前图形问题

我有一个图形子类。我的尝试是附加一个 subgaph（也是 igraph.Graph 的一个实例）作为联合

import igraph

class Graph(igraph.Graph):

    def __init__(self,param_1,param_2):
        self.param_1 = param_1
        self.param_2 = param_2
        super(Graph,self).__init__()

    def append_subgraph(self,subgraph):
        self = igraph.union([self,subgraph])

def execute():
    graph = Graph(None,None)
    graph2 = Graph(None,None)
    graph.append_subgraph(graph2)
    print(graph)

if __name__ == '__main__':
    execute()

当我在这个类的一个实例上执行这个方法时，我得到一个错误

File "/usr/local/lib/python3.9/site-packages/igraph/operators.py",line 180,in union
    res = _union(newgraphs,edgemaps)
TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument '__ptr'

虽然，当我合并 2x 个单独的图形而不引用 self 时，此问题不适用。

以前有人遇到过这个问题吗？

解决方法

我将创建一个最小的示例来复制这个问题，然后向您展示如何解决它，但首先让我们检查图形联合是否有错误（为了我的方便，一切都将在 ipython 中完成）：

In [36]: import igraph as ig
...: ig.union((ig.Graph(),ig.Graph()))
Out[36]: <igraph.Graph at 0x24343faab80>

好的，我们知道联合是有效的，让我们尝试一个最小的继承：

In [37]: class Graph(ig.Graph):
    ...:     ...
    ...: ig.union((Graph(),Graph()))
Out[37]: <__main__.Graph at 0x24343faac70>

到目前为止，一切都很好。让我们尝试添加新的 __init__：

In [38]: class Graph(ig.Graph):
    ...:     def __init__(self,p,q):
    ...:         self.p = p
    ...:         self.q = q
    ...:         super().__init__()
    ...: ig.union((Graph(1,2),Graph(1,2)))
---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-38-68cf6a0e1e15> in <module>
      4         self.q = q
      5         super().__init__()
----> 6 ig.union((Graph(1,2)))

c:\python38\lib\site-packages\igraph\operators.py in union(graphs,byname)
    178     # If any graph has any edge attributes,we need edgemaps
    179     edgemaps = any(len(g.edge_attributes()) for g in graphs)
--> 180     res = _union(newgraphs,edgemaps)
    181     if edgemaps:
    182         graph_union = res["graph"]

TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument '__ptr'

这是我们的错误。 igraph 期望 Graph 接受与 ig.Graph 相同的参数和关键字参数。这是我们可以修复它的方法：

In [39]: class Graph(ig.Graph):
    ...:     def __init__(self,*args,p=None,q=None,**kwargs):
    ...:         self.p = p
    ...:         self.q = q
    ...:         super().__init__(*args,**kwargs)
    ...: ig.union((Graph(p=1,q=2),Graph(p=1,q=2)))
Out[39]: <__main__.Graph at 0x24343faa400>

我们更改了 __init__ 的签名以接受任意位置参数，我们的特定参数作为关键字参数，然后是任意关键字参数。现在，igraph 可以传递它传递给 ig.Graph 的相同参数。希望这会有所帮助！