有没有办法对当前在 Pandas 数据帧中的行进行迭代的代码进行矢量化?

如何解决有没有办法对当前在 Pandas 数据帧中的行进行迭代的代码进行矢量化?

我现在有一些代码可以正常工作,但速度太慢了。我正在尝试将 Pandas 数据框中每一行的加权平方和相加。我想对这些操作进行矢量化——这似乎运行得快得多——但是代码中的一个问题使我的矢量化尝试失败了。

await

该行有 'students'(一个整数)、distance(一个长度为 n 的 numpy 数组)和 schoolChoice(一个小于或等于 n-1 的整数,它指定我使用的距离数组的哪个元素)计算)。基本上,我从 numpy 数组中提取特定于行的值。我使用过 df.lookup,但实际上它似乎更慢并且正在被弃用。关于如何使这个运行更快的任何建议?提前致谢!

解决方法

如果所有其他方法都失败了,您可以在每一行使用 .apply()

totalSum = df.apply(lambda row: row.distance[row.schoolChoice] ** 2 * row.students,axis=1).sum()

为了更快,您可以导入 numpy

totalSum = (numpy.stack(df.distance)[range(len(df.schoolChoice)),df.schoolChoice] ** 2 * df.students).sum()

numpy 方法要求每行的距离长度相同 - 但是如果需要,可以将它们填充到相同的长度。 (尽管这可能会影响取得的任何收益。)

在 150,000 行的 df 上进行测试,例如:

         distance  schoolChoice  students
0       [1,2,3]             0         4
1       [4,5,6]             2         5
2       [7,8,9]             2         6
3       [1,3]             0         4
4       [4,6]             2         5

时间:

         method    time
0      for loop   15.9s
1      df.apply    4.1s
2         numpy    0.7s

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