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从 R 中的 CSV 文件创建镶木地板文件目录

如何解决从 R 中的 CSV 文件创建镶木地板文件目录

我遇到越来越多的情况,需要使用内存不足 (OOM) 方法在 R 中进行数据分析。我熟悉其他 OOM 方法,例如 sparklyrDBI但我最近遇到了 arrow 并想进一步探索它。

问题是我通常使用的平面文件足够大,在没有帮助的情况下无法将它们读入 R。因此,理想情况下,我更喜欢一种进行转换的方法,而实际上不需要首先将数据集读入 R。

如果您能提供任何帮助,我们将不胜感激!

解决方法

arrow::open_dataset() 可以处理文件目录并查询它们,而无需将所有内容读入内存。如果您确实想将数据重写到多个文件中,可能由数据中的一列或多列分区,您可以将 Dataset 对象传递给 write_dataset()

一个(临时)警告:从 {arrow} 3.0.0 开始,open_dataset() 只接受一个目录,而不接受一个文件路径。我们计划在下一个版本中接受单个文件路径或离散文件路径列表(请参阅 issue),但现在如果您只需要读取其他非数据文件所在目录中的单个文件,您需要将它移动/符号链接到一个新目录并打开它。

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