如何解决有没有办法在 JAGS 中获取和存储矩阵元素的位置?
我正在 R 中开发贝叶斯分层模型,在 JAGS 中使用 BUGS 代码。
在我的模型中,我有两个矩阵,它们在相同的矩阵位置包含彼此的相关信息。我的信息是按行组织的。我按行对第一个矩阵 distmat 应用数学运算:
diffmat[i,j] <- abs(distmat[birthterr[i],j] - dist[i])
我有兴趣在新向量中记录 diffmat 每一行中每个最小值的列位置,然后将此向量应用于第二个矩阵。这在使用函数“which”或“which.min”的常规R代码中相对容易:
a <- numeric()
for (i in 1:dim(diffmat)[1])
for (j in 1:dim(diffmat)[2])
a[i] <- which.min(diffmat[i,])
然后将向量“a”应用于第二个矩阵(termmat)以获得与 distmat 位置关联的值:
b <- numeric(0)
for (i in 1:dim(diffmat)[1])
for (j in 1:dim(diffmat)[2])
b[i] <- terrmat[i,a[i]]
但是,显然 BUGS 代码无法识别 which 或 which.min(),我正在努力寻找一种方法将这些矩阵行位置存储在向量中。也许对此有一个非常简单的解决方案,但我真的陷入了困境。希望我的信息足够清楚。
任何建议将不胜感激。感谢您的时间!
解决方法
这是一个最小的工作示例。这里的类比是 x
将是您的 diffmat
。我在这里随机绘制它,但如果您以其他方式定义它,它应该仍然有效。本质上,您对每一行中 x
的值进行排名,并创建一个新矩阵 e
,该矩阵是一个虚拟矩阵,如果 x[i,j]
排名为 1,则编码为 1,否则为 0。然后,假设 1:ncol(terrmat)
和 terrmat
具有相同的维度,您取其内积和来自 diffmat
的值向量。然后,这将为您提供观察 i
的第一个排名值的列索引。下面示例中的 ymat
是您的 terrmat
所在的位置。我认为它在任何实际大小的问题上都会很慢,但它似乎可以从下面的输出中工作。
dl <- list(
ymat = matrix(1:3,ncol=3,nrow=5,byrow=TRUE),yinds = 1:3
)
mods <- "model{
for(i in 1:5){
for(j in 1:3){
x[i,j] ~ dnorm(0,1)
e[i,j] <- equals(rx[i,j],1)
}
rx[i,1:3] <- rank(x[i,1:3])
ind[i] <- inprod(e[i,],yinds)
yval[i] <- ymat[i,ind[i]]
}
}"
library(runjags)
out <- run.jags(mods,data=dl,monitor="yval")
out
#
# JAGS model summary statistics from 20000 samples (chains = 2; adapt+burnin = 5000):
#
# Lower95 Median Upper95 Mean SD Mode MCerr MC%ofSD SSeff AC.10 psrf
# yval[1] 1 2 3 1.9973 0.8139 2 0.0058421 0.7 19409 -0.0077146 0.99996
# yval[2] 1 2 3 2.0067 0.81605 3 0.0057704 0.7 20000 0.00049096 1.0003
# yval[3] 1 2 3 1.9895 0.8142 2 0.0057573 0.7 20000 0.00066309 1
# yval[4] 1 2 3 1.9973 0.81638 1 0.0057727 0.7 20000 -0.00040016 0.99998
# yval[5] 1 2 3 1.993 0.81611 1 0.0057708 0.7 20000 -0.0027988 0.99996
#
# Total time taken: 0.7 seconds
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