检查列表中的元素是否存在于 txt 文件的字符串中不工作Python

如何解决检查列表中的元素是否存在于 txt 文件的字符串中不工作Python

我尝试了很多方法，但根本没有得到任何输出。我有一个包含不同类型字符串的列表：

lst=['ATCGG','GTAACGCT','AATCGAT',...]

我有一个如下的文本文件：

>seq1
NNNGTAACGCTNNN
>seq2
NNNNNAATCGATNNNN
>seq3
NNNNNNNN
.
.
.

如果行中存在列表中的任何项目，我想打印文本文件的行。根据上面的示例，所需的输出应该是：

NNNGTAACGCTNNN
NNNNNAATCGATNNNN

我使用了下面的命令，但没有打印出来：

main_file =  open('test_file.txt','r')
contn = main_file.read()
#print(contn)


for dna in contn:
    if any(i in dna for i in lst):
        print(dna)

解决方法

您需要 readlines 而不是 read，read 将创建单个字符串，因此当您迭代时，dna 实际上只是单个字符

contn = main_file.read()

应该

contn = main_file.readlines()

,

直观的显式循环版本：

def find_lines_containing_any(filename,wanted_list):
    with open(filename,'r') as dna_file:
       for dna_line in dna_file:
            for wanted in wanted_list:
                if wanted in dna:
                    yield dna

for dna in find_lines('test_file.txt',lst):
    print(dna)

,

使用 for dna in contn，当 read() 返回一个 str 对象时，您正在遍历字符，您可以简单地执行：

main_file =  open('test_file.txt','r')
for line in main_file:
    if any(i in line for i in lst):
        print(line)