在 Emacs polymode 中将 .Rmd 编​​织为 .pdf 和 .html 时如何获得簇绒风格的导出输出？

如何解决在 Emacs polymode 中将 .Rmd 编​​织为 .pdf 和 .html 时如何获得簇绒风格的导出输出？

我正在尝试使用 tufte style export output .Rmd 文件（不是 .org 文件！）到 .pdf 和 .html 时获取 knitting 3}} 在 Emacs 中。但是，knitr 不考虑以下 YAML 代码...

---
title: "The title"
date: "2021-02-28"
draft: false
categories: [""]
runningheader: "The title" 
subtitle: ""
author: "Me"
output:
  tufte::tufte_handout:
  latex_engine: xelatex
tufte::tufte_book:
citation_package: natbib
latex_engine: xelatex
bibliography: library.bib
link-citations: no
header-includes:
- \usepackage{draftwatermark}
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```{r,include=FALSE}
options(tinytex.verbose = TRUE)
```
---

```{r setup,include=FALSE}
library(tufte)
# invalidate cache when the tufte version changes
knitr::opts_chunk$set(cache.extra = packageVersion('tufte'))
options(htmltools.dir.version = FALSE)
```

相反，当我在 Emacs 中使用命令 polymode-export 时，polymode 使用一些其他输入来编织和导出。我现在想知道，polymode 从哪里获取输入，以及如何编辑它？

对于 .pdf，编织导致以下错误：

/usr/local/bin/pandoc +RTS -K512m -RTS kappa.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output /Users/joafr/Documents/phd/thesis/kappa/kappa-exported.tex --lua-filter /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/rmarkdown/rmarkdown/lua/pagebreak.lua --lua-filter /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library/rmarkdown/rmarkdown/lua/latex-div.lua --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --include-in-header /var/folders/nb/8g7b_8116yqccd8y72r8llh80000gn/T//RtmpueFAws/rmarkdown-str525c5bcb4368.html --variable 'geometry:margin=1in' --citeproc 
This is pdfTeX,Version 3.14159265-2.6-1.40.21 (TeX Live 2020) (preloaded format=pdflatex)
 restricted \write18 enabled.
entering extended mode
I was unable to find any missing LaTeX packages from the error log kappa-exported.log.
! Undefined control sequence.
l.100 \newthought
                 {Collaborative approaches in research} are partly an 

Error: LaTeX Failed to compile /Users/joafr/Documents/phd/thesis/kappa/kappa-exported.tex. See https://yihui.org/tinytex/r/#debugging for debugging tips. See kappa-exported.log for more info.

至于 .html 输出，它呈现语义正确的导出输出，但在字体和边注方面，样式不是我想要的 tufte 样式。

如果有人能在这里帮助我，非常感谢。而且我对使用 org-mode 不感兴趣，因为我更喜欢用 Rmarkdown 编写，所以请不要尝试将我转换为 org-mode。