将一个长字符串写入文件

如何解决将一个长字符串写入文件

我有很长的蛋白质序列字符串需要写入文件。在写入文件或打印时,它会保留省略号 (...) 并截断字符串

[[SeqRecord(seq=Seq('MSDQDHSMDEMTAVVKIEKGVGGNNGGNGNGGGAFSQARSSSTGSSsstGGGGQ...NGF'),id='sp|P08047|SP1_HUMAN',name='sp|P08047|SP1_HUMAN',description='sp|P08047|SP1_HUMAN Transcription factor Sp1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SP1 PE=1 SV=3',dbxrefs=[])],

在这里,在将它写入文件之前,我已将其类型转换为字符串。也许这就是问题所在,但它必须以字符串格式写入文件

for idx,id in enumerate(ids):
    baseUrl="http://www.uniprot.org/uniprot/"
    currentUrl=baseUrl+id+".fasta"
    response = r.post(currentUrl)
    cData=''.join(response.text)
    Seq=StringIO(cData)
    pSeq=list(SeqIO.parse(Seq,'fasta'))
    all_sequences.append(pSeq)
    # write results in the file
    f = open( 'oGlcNAo_sequences_.txt','a' )
    f.write(str(pSeq))
    sleep(0.05) # Time in second
    if idx%100 ==0:
        print("Working on ID: "+str(idx)+'--'+ id)

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


Selenium Web驱动程序和Java。元素在(x,y)点处不可单击。其他元素将获得点击?
Python-如何使用点“。” 访问字典成员?
Java 字符串是不可变的。到底是什么意思?
Java中的“ final”关键字如何工作?(我仍然可以修改对象。)
“loop:”在Java代码中。这是什么,为什么要编译?
java.lang.ClassNotFoundException:sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcDriver发生异常。为什么?
这是用Java进行XML解析的最佳库。
Java的PriorityQueue的内置迭代器不会以任何特定顺序遍历数据结构。为什么?
如何在Java中聆听按键时移动图像。
Java“Program to an interface”。这是什么意思?
Java在半透明框架/面板/组件上重新绘画。
Java“ Class.forName()”和“ Class.forName()。newInstance()”之间有什么区别?
在此环境中不提供编译器。也许是在JRE而不是JDK上运行?
Java用相同的方法在一个类中实现两个接口。哪种接口方法被覆盖?
Java 什么是Runtime.getRuntime()。totalMemory()和freeMemory()?
java.library.path中的java.lang.UnsatisfiedLinkError否*****。dll
JavaFX“位置是必需的。” 即使在同一包装中
Java 导入两个具有相同名称的类。怎么处理?
Java 是否应该在HttpServletResponse.getOutputStream()/。getWriter()上调用.close()?
Java RegEx元字符(。)和普通点?