coda.samples 中的迭代次数和薄值

如何解决coda.samples 中的迭代次数和薄值

关于rjags中的以下coda.samples，

samples<-coda.samples(jags,c('B','A'),5000,thin=5)

迭代设置为5000，thin参数设置为5。贝叶斯分析中是否有设置这两个参数的机制或​​规则。

解决方法

您的意思是“有没有办法为这些参数定义‘正确’或‘最佳’值？
如果是这样，那么答案是“否”。不是 R 或任何语言。您需要查看模型拟合的诊断信息（例如跟踪图、Gelman-Rubin、Raftery-Lewis 和 Heidelberger-Welch 统计）并调整 MCMC 过程的参数，直到获得“可接受”的结果。这是一门艺术，而不是确定性算法。

您还应该查看您使用的链条数量，以及每条链条的老化、变薄等参数。