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从 Spacy 2.3.1 迁移到 3.0.1

如何解决从 Spacy 2.3.1 迁移到 3.0.1

代码在使用 Spacy 2.3.1 时按预期工作,但在使用 Spacy 3.0.1 时在第三行抛出异常(我们还将 scispacy 从 .0.2.5 更新到 0.4.0:

entity_linker = UmlsEntityLinker(resolve_abbreviations=True)
nlp = spacy.load('en_core_sci_sm')
nlp.add_pipe(entity_linker)

例外是:

/scispacy/label_text/ [E966] nlp.add_pipe 处的 ValueError 现在需要 已注册组件工厂的字符串名称,不是可调用的 成分。预期的字符串,但得到 名称:'无')。

  • 如果您使用 nlp.create_pipe('name') 创建组件:删除 nlp.create_pipe 并改为调用 nlp.add_pipe('name')

  • 如果你传入了一个TextCategorizer() 这样的组件:用字符串名称调用 nlp.add_pipe,例如 nlp.add_pipe('textcat')

  • 如果您使用自定义组件:添加装饰器 @Language.component(用于函数组件)或 @Language.factory (对于类组件/工厂)到您的自定义组件并分配 它是一个名字,例如@Language.component('your_name')。然后你可以运行 nlp.add_pipe('your_name') 将其添加到管道中。

我没有使用自定义组件。建议?

解决方法

UmlsEntityLinker 确实是来自 scispacy 的自定义组件。

看起来相当于 v3 的是:

nlp.add_pipe("scispacy_linker",config={"resolve_abbreviations": True,"linker_name": "umls"})

见:https://github.com/allenai/scispacy#example-usage-1

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