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Seurat 元数据的特征图

如何解决Seurat 元数据的特征图

假设我有一个名为 seur 的 Seurat 对象,其元数据包括一个名为“count”(双精度列表)的列,该列显示某个单元格出现的次数。我想使用 FeaturePlot 工具在我的 UMAP 上绘制计数,以便我可以通过颜色渐变查看高计数的位置。

然而,当我这样做时:

FeaturePlot(seur,features = "count")

我收到错误

count.Error in if (unique.feature.exp == 0) { : 
 missing value where TRUE/FALSE needed

如何解决错误和/或正确使用 FeaturePlot?

解决方法

它应该可以工作,检查您有 Seurat 3 还是 Seurat 4,我正在使用下面的 Seurat_3.2.2:

library(Seurat)
seur = pbmc_small
eur$count = rpois(ncol(seur),5)
FeaturePlot(seur,features="count")

enter image description here

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