如何解决如何从 R 中的外部函数创建一个稀疏矩阵？
在我的代码中，外部函数输出一个矩阵。是否有可能使输出稀疏矩阵？我可以将这个输出矩阵转换为一个稀疏矩阵，但我想做一些类似 outer(......,sparse=T) 的事情，而不是先有密集矩阵然后再转换。因为我有非常大的数据。我的代码和简短的示例向量如下。我已阅读所有相关帖子，但无法弄清楚。
# myvec is a vector of length 100.
# mycol is a column vector of length 10.
myvec <- c( 0,1,2,3,3)
mycol <- c(-15.07,-7.64,-15.48,-18.59,-12.35,-10.44,-11.45,-18.49,-15.24,-13.23)
res <- outer(1:length(mycol),1:length(mycol),function(i,j) {
ifelse(myvec > 1,ifelse(myvec == 1,(mycol[j]-mycol[i])/(1-exp(-(mycol[j]-mycol[i]))),ifelse(myvec ==0,myvec)))})
我还尝试使用行、列、值三元组从头开始创建一个稀疏矩阵，我的代码如下。但是因为条目 (resvec) 长度是 100，所以创建了稀疏矩阵，但只使用对角线的前 10 个条目，其余的非对角线元素为零。但我想将所有 100 个条目都写入它们的位置。
非常感谢。
resvec<- as.vector(res)
matSparse <- sparseMatrix(
i = 1:length(mycol),j = 1:length(mycol),x = resvec,dims = c(length(mycol),length(mycol)),dimnames = list(rownames,colnames)
)
ps：行名和列名相同。
解决方法
类似这样的事情，我只是重做 outer 所做的事情，但只是针对产生非零结果的 myvec 值。您可以稍微简化函数 f，也可以将其设为 myvec 的函数。
f <- function(i,j) {
ifelse(myvec > 1,ifelse(myvec == 1,(mycol[j]-mycol[i])/(1-exp(-(mycol[j]-mycol[i]))),ifelse(myvec ==0,1,myvec)))}
library(Matrix)
i <- rep(1:length(mycol),times = length(mycol))[myvec < 2]
j <- rep(1:length(mycol),each = length(mycol))[myvec < 2]
myvec <- myvec[myvec < 2]
sparseMatrix(i,j,x = f(i,j))
#> 10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#>
#> [1,] 1.000000000 7.434410 1.000000000 . 2.9118151 4.675609 . 1.0000000 0.91740717 .
#> [2,] 0.004409999 1.000000 0.003087581 . 1.0000000 . 0.08629586 . . 0.02095708
#> [3,] 1.218969243 . . 0.14518433 . . . 0.1560604 . 1.00000000
#> [4,] . 10.950192 3.255184331 1.00000000 6.2521909 . . . . 5.38531586
#> [5,] 0.191815105 . 1.000000000 0.01219087 . 2.241996 . 0.0132598 0.17006693 0.62371549
#> [6,] . 2.981293 . . 0.3319956 . 0.57859728 . . .
#> [7,] . . 0.072926774 . 1.0000000 1.588597 1.00000000 . 0.08761709 0.36106528
#> [8,] . . . . 6.1532598 1.000000 7.04617334 . 1.00000000 .
#> [9,] 1.087407174 . 0.884795398 0.12180607 3.0600669 . . 0.1310995 . .
#> [10,] . 5.610957 . . . 2.972579 2.14106528 1.0000000 0.31098581 .
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