如何解决CWL:创建输入 yaml - ruamel comments.py 问题
我使用的是 import pyspark.sql.functions as F
df2 = df.withColumn('col_b',F.regexp_replace(F.format_number('col_b',3),',''))
df2.show()
+-----+------+
|col_a| col_b|
+-----+------+
| A|10.000|
| B|11.100|
| C|12.340|
| D|23.456|
| E|34.568|
+-----+------+
附带的 cwltool 版本 3.0.20201203173111。这可能是 ruamel 或我的工作流程的问题,但这里是运行命令和回溯:
pip install cwl-runner
回溯:
cwltool --make-template --debug tumor_only_exome.cwl > hiv_input.yml
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