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在我的集群节点上运行 jupyter notebookHPC 设施

如何解决在我的集群节点上运行 jupyter notebookHPC 设施

我试图在具有 56 cores 的 HPC 设施上运行我的 Python 代码,并且我想将我的程序使用的内核数量限制在 20 左右。我已经阅读了一些关于 qsub内容并尝试使用它并使用了以下命令:

qsub -pe smp 20 script.sh 

每次我提交作业时,它都会占用所有 56 cores,但我希望它只占用 20。有什么办法可以做到这一点吗?

以下是script.sh的内容

#!/bin/bash
#$ -N example
#$ -cwd
/opt/anaconda3/bin/jupyter nbconvert --to notebook --execute input.ipynb --output output.ipynb --ExecutePreprocessor.timeout=None 

我没有优化 input.ipynb 中的代码以处理固定数量的内核。如果我也必须发布这个 ipynb 的代码,请告诉我。

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