如何在Julia中使用Anaconda中没有的需要通过pip安装的Python包

如何解决如何在Julia中使用Anaconda中没有的需要通过pip安装的Python包

我使用 Julia 1.6.0（截至今天是测试版）并希望通过 plfit 使用 Python 包 PyCall。

不幸的是，plfit 在 Anaconda 中不可用，因此我无法使用 Conda 模块安装它：

julia> using Conda

julia> Conda.add("plfit")
[ Info: Running `conda install -y plfit` in root environment
Collecting package Metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: Failed with initial frozen solve. retrying with flexible solve.
Collecting package Metadata (repodata.json): done
Solving environment: Failed with initial frozen solve. retrying with flexible solve.

PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:

  - plfit

...

我如何从 Julia 安装这个包？

解决方法

您可以通过 pip 模块从 Julia 运行 PyCall。

此外，包 plfit 引用了一个 cython 包，该包不存在于 Python 内置的 Julia 中，并且不会自动安装。因此你需要做：

using PyCall
run(`$(PyCall.python) -m pip install --upgrade cython`)
run(`$(PyCall.python) -m pip install plfit`)

现在可以从 Julia 使用 plfit 包：

julia> plfit = pyimport("plfit");

julia> x=rand(1000);

julia> myplfit = plfit.plfit(x)
PYTHON plfit executed in 0.064029 seconds
xmin: 0.397582 n(>xmin): 625 alpha: 2.92546 +/- 0.0770183   Log-Likelihood: 36.3511   ks: 0.197384 p(ks): 4.09676e-22
PyObject <plfit.plfit.plfit object at 0x0000000064871A90>

最后，请注意，有时以这种方式安装的某些软件包在查找二进制 Python 依赖项时可能会出现问题（plfit 并非如此）。在这种情况下，您需要将文件夹 %HOMEPATH%\.julia\conda\3\Library\bin 添加到您的 PATH 环境变量（根据您的配置和平台将 %HOMEPATH%\.julia 替换为 JULIA_DEPOT_PATH 或适当的系统路径）。

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您也可以将 pip 与 Conda.jl（PyCall 附带）一起使用：

https://github.com/JuliaPy/Conda.jl#conda-and-pip