如何解决如果集群作业被杀死,Snakemake 从主节点删除输出文件
我正在使用 slurm 作业队列系统在集群的登录节点上运行 snakemake。
不幸的是,如果 slurm 作业超时,或者它被 scancel
杀死,作业中的 snakemake 脚本不会删除输出文件,因为它也会被杀死。
然而,在这种情况下,snakemake 主进程仍然存在,所以我希望这个进程删除失败的子作业的输出文件。有没有办法做到这一点,或者一些黑客可以做到这一点?
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。