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从 jupyter notebook 内部调用 ImageJ/FIJI 宏

如何解决从 jupyter notebook 内部调用 ImageJ/FIJI 宏

我想使用 ImageJ 和它的一些宏,并从 jupyter notebook 内部调用它们。我知道 PyimageJ,并且我已经能够安装它并使用 ImageJ 方法加载要显示的图像。但是我在掌握如何调用和运行 imageJ 附带的基于 Java 的插件或加载用户编写的宏时遇到了一些困难。

我一直在看这个例子:https://omero-guides.readthedocs.io/en/latest/fiji/docs/imagej_python.html

有问题的示例实际上是针对 Omero,我不需要也没有访问权限(需要注册 Omero)。

我想我对跨平台工作缺乏更横向的理解,有人可以帮我吗?

非常感谢。

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