R Igraph 错误：“权重向量必须为正，值无效”

如何解决R Igraph 错误：“权重向量必须为正，值无效”

我在 iGraph 中构建了多个图表。在每个图中，节点代表单词，边权重表示作为对单词 B 的响应（在单词关联任务中）给出单词 A 的次数。 0 和 1 使用以下代码：

E(G)$weight <- E(G)$weight / max(E(G)$weight)

这些值在分析节点/网络强度时是合适的，但在计算与介数相关的函数时（例如调用介数函数，或使用基于介数的社区检测，它们需要更改为距离 - 即倒置：

： >

G2 = G
E(G2)$weight = 1 - E(G2)$weight

问题是这会导致向量包含几个 0（即那些在反转之前强度为 1 的向量。这导致（至少，我认为这是原因）在错误消息中，例如：

Error in cluster_edge_betweenness(G2.JHJ.strong,weights = E(G2.JHJ.strong)$weight,: 
  At community.c:455 : weights must be strictly positive,Invalid value

对此可以做些什么？

谢谢，

彼得

解决方法

如果您想安全一点，您可以尝试使用 sum 而不是 max 来标准化权重，例如，

E(G)$weight <- E(G)$weight / sum((E(G)$weight)

或

E(G)$weight <- 2**((E(G)$weight - min(E(G)$weight)) / diff(range(E(G)$weight)))