如何解决将文件写入 zarr.storage.DBMStore 时超时,导致整个 zarr 存储不可读
我是 zarr 的新手,正在尝试使用 Xarray 将文件输出到 zarr.storage.DBMStore。由于数据集非常大,我多次计算并将结果输出到一个 zarr.storage.DBMStore(附加 dim='time')。但是,每次程序因超时而失败时(我每次都从队列中请求 4 小时),我似乎无法访问之前已写入此 zarr 存储的文件。我想知道如何处理这样的问题?
以下是我在 zarr 存储中写入和读取文件的代码,以及超时尝试后的错误消息:
import zarr
import xarray
store= zarr.DBMStore('/scratch/brown/kong97/WBGT/cmip6/GFDL_CM4_WBGT.bdb',open=bsddb3.btopen)
#doing some calculations and get the output: WBGT
WBGT.to_zarr(store,append_dim='time')
store.close()
超时错误后:
store= zarr.DBMStore('/scratch/brown/kong97/WBGT/cmip6/GFDL_CM4_WBGT.bdb',open=bsddb3.btopen)
test=xr.open_zarr(store)
raise error: DBPageNotFoundError: (-30985,'BDB0075 DB_PAGE_NOTFOUND: Requested page not found')
感谢任何帮助!
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。