如何解决mpi4py 和 ctypes - 每当单个线程退出时,带有 MPI 的 Python 程序就会退出通过 C++
(这里使用的代码和我今天贴的另一个问题类似,只是两个问题不同)
我正在使用带有 python3 接口的复杂 C++ 代码(使用 ctypes)。为简单起见,我在下面复制了一个简单的 C++ 代码来构建我的问题。函数 exitOrNot() 接受一个参数 index
并在它等于 7 时退出。
multi.cpp
#include <iostream>
#include <cstdlib>
extern "C" int exitOrNot(int index) {
int ret;
if(index == 7) {
std::cout << "EXITING... \n";
std::exit(EXIT_FAILURE);
}
else {
sleep(1)
ret = index;
}
return ret;
}
我使用以下命令为上述程序 libmulti.so 创建了一个共享库 - g++ -fPIC -shared -o libmulti.so multi.cpp
在我的 Python 模块中,我使用 mpi4py 进行并行处理。在这个简单的例子中,我有两个函数 - ctypes_exitOrNot() 用于接收之前的 C++ 函数,multi() 用于迭代多个输入参数(在本例中,5*100=500 个参数)。
multi.py
import numpy as np
from mpi4py import MPI
import ctypes
_multi = ctypes.CDLL('./libmulti.so')
def ctypes_exitOrNot(index):
ret = _multi.exitOrNot(ctypes.c_int(index))
return ret
def multi(N):
comm = MPI.COMM_WORLD
rank = comm.Get_rank()
N_threads = comm.Get_size()-1 # Thread 0 is used only for IO
N_jobs = N
N_jobs_per_thread = int(np.ceil( float(N_jobs)/float(N_threads) ))
print("\nrank",rank,"N_threads",N_threads,"N_jobs_per_thread",N_jobs_per_thread,"\n")
indices = range(rank-1,N_jobs,N_threads)
if rank == 0: # IO thread
completed_ranks = []
while True: # Wait to receive data until all threads are done
status = MPI.Status()
data = comm.recv(source=MPI.ANY_SOURCE,tag=MPI.ANY_TAG,status=status)
received_rank = status.Get_source()
if data == "done":
completed_ranks.append(received_rank)
else:
index_system = data["index_system"]
with open("completed.txt","a") as file_completed:
file_completed.write(str(index_system) + '\n')
if len(completed_ranks)==N_threads:
print("\nrank 0 -- all threads done; completed_ranks",completed_ranks,"\n")
break
else:
for index_rank,index_job in enumerate(indices):
index_system = index_job
print("rank","index_system",index_system,"started")
# EXITING CONDITION FROM EXTENAL C++
ret = ctypes_exitOrNot(index_system)
data = {"index_system":ret}
print("rank","ended")
comm.send(data,dest=0,tag=index_system)
# This thread is done
data = "done"
comm.send(data,tag=index_system)
if __name__ == '__main__':
multi(5*100)
上面代码的重要一行是ret = ctypes_exitOrNot(index_system)
。传递给 exitOrNot() 的整数参数是索引 0-499,当它们被分成不同的线程时,索引为 7 的线程退出。作为参考,我的终端命令是 - 'mpiexec -n 6 python3 multi.py'
我终于来回答我的问题了。当一个线程通过 C++ 退出时(就像在这种情况下),整个程序退出,即所有其他线程也退出。但是,当从 Python 内部完成相同的退出时,其他线程会继续运行。
有没有办法让其他线程即使其中一个通过 C++ 退出也能继续运行? (我无法编辑实际的 C++ 文件本身)
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