如何解决使用间隙成本函数找到 2 个字符串之间的最佳对齐
我有一个作业问题，我试图解决好几个小时都没有成功，也许有人可以指导我以正确的方式思考它。
问题：
给定两个字符串 S1 和 S2，找到它们与间隙的最佳全局对齐的分数。 差距成本由一般函数-?(?) 给出。众所周知，对于间隙长度-? ≥ ?，?(?) 等于常数 C。
建议使用space O(min{|S1|,|S2|}*d)和time O(|S1|*|S2|*d).解决问题的算法
说明：在每个矩阵条目选择最佳间隙长度时，分别处理间隙 长度小于 d 和更长的间隙。将得到的最优值存储在每个矩阵条目中 除了常规的最佳值之外，还使用更长的间隙。
现在我们学习了以下两种算法：
与我们对成本函数一无所知的差距对齐：
与仿射间隙成本函数对齐
我的解决方案：
我知道我必须使用d-rows表才能满足空间要求，
并使用这两种方法，但我无法将其组合成一个递归公式，
这是我到目前为止所做的：
但我不确定如何包括延长比 d 长的现有间隙的成本，甚至不确定如何检查我的递归公式是否正确。 任何帮助将不胜感激！
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