如何解决for 循环脚本仅在目录中的最后一个文件上完全执行
我正在尝试在 ~300 个文件上使用 prokka 运行 for 循环。当我运行代码时，它会为每个包含 .log 文件的示例创建一个新文件夹 - 在这里一切正常。然而，当它开始运行下一段启动基因组注释的代码时，prokka 只在系列中的最后一个文件上运行。
我尝试了几乎所有我能想到的迭代，但我仍然遇到困难。如果有人能让我走上正确的道路，我将不胜感激！
cd /file/directory
for F in *.fasta;
do
N=$(basename "$F" .fasta);
prokka --locustag "$N" --outdir "$N" --prefix "$N" --compliant --Metagenome --coverage 90 "$F";
done
prokka 版本 1.14.5 并在 bash 脚本中工作
谢谢！
梅根
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