蛇形根据重启尝试调整时间限制

如何解决蛇形根据重启尝试调整时间限制

我有一个工作流，它需要一个 slurm 集群具有不同资源需求（内存和时间）的令人尴尬的并行步骤。我按照文档装饰了工作流程：

rule freebayes:
    ...
    resources:
        mem = lambda wildcards,attempt: attempt * 6144,time = lambda wildcards,attempt: attempt * 12 * 60
    ...

这样就提交成功了，内存需求也正确请求了，但是time需求设置为配置文件中的默认值。在日志中似乎没问题：

resources: mem=6144,time=720

我也尝试以字符串形式请求时间：

time = lambda wildcards,attempt: str(attempt * 12) + ":00:00"

也提交正常但仍设置为默认时间。

我做错了什么？

解决方法

我刚刚注意到我做错了什么。由于以下行，我的 cluster.json 覆盖了请求：

"__default__":
{
    "time": "24:00",},

我删除了它，现在它可以正常工作了。